وضعت وزارة الاوقاف والشؤون الاسلامية يدها على الكثير من الممارسات الخاطئة التي كانت تتم في المركز العالمي للوسطية، وهي تأتي من ضمن الخطوات الاصلاحية في الوزارة، وقد شكل وزير العدل وزير الاوقاف يعقوب الصانع لجنة تحقيق حول المخالفات المنسوبة للمركز العالمي للوسطية وللتأكد من عدم وجود نصوص قرآنية ونبوية في مطبوعات ونشرات المركز جيرت لتخدم فكر التطرف والخروج على الحكومات.
وكشف مصدر مسؤول أن اللجنة شكلت بالقرار رقم 180 لسنة 2014 برئاسة وكيل الوزارة المساعد لشؤون الخبرة والتحكيم في وزارة العدل خالد الدخيل وعضوية المستشار أسامة أبو الخير والدكتور سلطان العيسى من المكتب الفني بوزارة العدل وعبدالرحمن العجمي من مكتب وزير الاوقاف، مبيناً انه "سيتم رفع تقرير للوزير الصانع شخصيا خلال شهر حول ما توصلت إليه اللجنة".
ومن جانبه أكد وكيل وزارة الأوقاف للشؤون الادارية والمالية الأمين العام للجنة العليا لتعزيز الوسطية فريد عمادي ان قرار الوزير "جاء في مصلحة الوطن بعدما تم اكتشاف كتب طبعت باسم مركز الوسطية تتضمن اساءة للكويت وثناء لبعض الرموز التي عرفت بتكفيرها للحكومات والمجتمعات الاسلامية مما يخالف الهدف الذي اسس من اجله المركز العالمي للوسطية".
واكد عمادي في تصريح الى صحيفة السياسة الكويتية الى "اكتشاف بعض المطبوعات التي تحرض الشعوب على حكوماتها، كما ان هناك اشخاصا نشرت لهم مطبوعات وهم معروفون بعدائهم للكويت".
وبشأن لجنة التحقيق، قال عمادي إن الوزير "له نظرة معينة في اختيار اللجنة حيث ان غالبية اعضائها من وزارة العدل وليس من الاوقاف"، في إشارة منه إلى الحرص على مهنية اللجنة وعدم تأثرها بأي تيار ديني أو قوى ضغط من داخل وزارة الاوقاف.