العلاقة متوترة بين وزارة التعليم العالي والطلبة الذي يدرسون بالخارج في بعض الجامعات التي ترفض الوزارة الاعتراف بها ، حيث استنكر امين سر الهيئة الادارية لتجمع طلبة الكويت المستقل في الاردن فارس الشمري قرار الغاء الاعتراف الأكاديمي بجامعة الزرقاء الاهلية وجامعة اربد الاهلية وجامعة فيلادلفيا وجامعة الاسراء، قائلا إنه لم تذكر أسباب الغاء الاعتراف الأكاديمي او أي مبرر من قبل الجهاز الوطني للاعتماد الاكاديمي.
وطالب الشمري في تصريح صحافي وزير التربية وزير التعليم العالي د. بدر العيسى باعادة النظر بتلك القرارات ورد الاعتراف بالجامعات. وبين ان تلك الجامعات التي تم سحب الاعتراف منها لديها العديد من الاتفاقيات بين الجامعات العالمية وليس لديها اي انذار اكاديمي، مؤكدا أن سوء الادارة ما بين الملاحق الثقافية والوزارة بات واضحاً، ولن يسمح التجمع بأن يقع طلبتنا في الأردن ضحية هذا الأمر.
يذكر ان وزارة التعليم العالي تنظر في ازمة ما يقارب 400 خريج من جامعات هندية و سلوفاكية و يونانية وفلبينية.